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软件化:生命科学新机遇

来源:UC论文网2019-05-18 10:26

摘要:

  如今生命科学和信息技术产业的联系已经非常紧密,行业互动也越来越频繁。Qiagen今年横扫加利福尼亚州雷德伍德城标志着这个生物科技巨头迈出了第一步,购置下一家专门制作软件的公司。借助该项收购,Qiagen就能够对有机体的基因图谱进行信息分析,就有望检测出导致疾病的变异及突变,并研发出新的治疗方法。  作者:张昕  该交易预示着生命科学和信息技术产业的联系将越发紧密,行业互动越来越频繁。  自从十...

  如今生命科学和信息技术产业的联系已经非常紧密,行业互动也越来越频繁。Qiagen今年横扫加利福尼亚州雷德伍德城标志着这个生物科技巨头迈出了第一步,购置下一家专门制作软件的公司。借助该项收购,Qiagen就能够对有机体的基因图谱进行信息分析,就有望检测出导致疾病的变异及突变,并研发出新的治疗方法。


  作者:张昕


  该交易预示着生命科学和信息技术产业的联系将越发紧密,行业互动越来越频繁。


  自从十几年前第一次绘制出人类基因组图谱以来,绘制有机体基因组的成本已大大降低——其普及程度之广,已经让科学家和医生开始畅想美好未来,基因图谱在不久的将来也许会成为最普通不过的医学实践。


  不过这种增殖却使得各公司、研究机构学术机构有了更高的需求,渴望有更快捷更完善的软件来处理大量的数据。


  “随着基因序列分析成本的降低,基因组数量猛增,对于分析这些基因信息的需求便日益高涨。”WilliamQuirk,PiperJaffray总经理如是说。


  在增长的需求下,一系列软件开发公司应运而生。在分析师和高管眼中,该市场已经准备好迎接创新,但缺少有序领导。


  Quirk表示,“这里有大量开放的机会,等待软件公司的进驻。”


  DevonJensen就是这股浪潮的弄潮儿之一。拥有分子和细胞生物学博士学位的他,两年前就于加州伯克利创立了EnlisGenomics。


  “不难看出这些可用的工具其实都是为专家学者服务的,并非为像我这种实验室走出来的人。”Jensen说道,“研究基因组其实有很多功用,我认为再继续发展下去的话,基因组会成为生物乃至医学世界的一个重要部分。”


  Jensen说他的公司卖的软件——旨在帮助研究人员了解遗传变异的重要性——面向广泛的顾客群体,包括临床实验室、高校、制药公司和医学博士。


  不过他的公司并不是唯一一家发现了市场机会的。


  位于圣地亚哥的CypherGenomics公司成立于两年前,由来自于附近斯克利普斯转化科学研究所的几个科学家一手建成,该公司也生产类似的软件。一旦某有机体的基因图谱被绘制出来,该软件就能测算出其变异并探测出该变异是否会引发健康问题。


  “这可是个大问题,所以很多人都跃跃欲试想解决这个问题。”首席执行官AshleyVanZeeland如是说。


  不过这块领域还处于刚刚起步的阶段,也就意味着在公司兼并重组或倒闭这样的格局形成阶段,大量的新鲜血液会持续涌入。VanZeeland表示随着技术日趋成熟,部分项目越发彰显其有效性,这一点会越来越明显。


  “该领域真正需要的是一套标准体系,这样我们就能衡量表现和精确度了。”她说道,“这块新兴领域就好像有待开发的广阔西部一样。”


  DNAStar,一家生命科学软件公司,并不是个陌生的名字。该公司于1984年由维斯康星大学一位遗传学教授和一位计算机科学专业学生共同创立。


  “他们恰好把握住了时机,因为当时正值个人计算机热潮的初始阶段。”TomSchwei,公司副总裁、首席财务官说道,“他们认为,只要他们能把软件这样工具交到有能力又技术娴熟的科学家手中,成功一定不远。”


  不过基因技术和测序技术在当时发展得相当缓慢,同现在的市场态势相比也更加昂贵。DNAStar从那时起便改良自己的软件,以适应现代实验室的需求,其一系列改良也包括了近几个月刚刚添加的基于互联网的“云”技术。


  Schwei表示DNAStar十几年前就见证了其竞争对手被大型生物医药公司收购,当时遗传学相当热门,人们对于遗传学将带领医学领域取得突破性进展的期待也正高涨,不过那些公司最终还是一起衰亡了。


  “这一行业有软件的一面,不过很难形成大规模以吸引上市公司的关注。”Schwei表示。


  不过这一点现在正在改变,当年未兑现的期待现在正一点一点变成现实。比如说DNAStar就曾签署过协议,允许美国生命技术公司销售其软件,不过前提是为其提供基因测序技术。


  “往往生产基因测序机器的公司并不擅长为其结果设计软件,所以他们自然会想办法为自己的产品增加价值。”EnlisGenomics的Jensen表示。


  正是这样的思路促使Qiagen于4月份买下了软件制作公司IngenuitySystems,而据分析家观察,随着基因软件市场逐渐成熟,将出现更多类似的兼并。

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